基督复临安息日会是全球性的组织。基层教会组合成区会，在经济上依赖于上一级的组织。(自立区会例外一编者按)区会组成联合会，联合会的设立是以国家，民族或语言而定。联合会再组成分会，分会是总部设在美国马里兰州银泉市全球总会的分支机构，分会共有12个，即非洲印度洋分会、东非分会、欧非分会、欧亚分会、中美分会、北美分会、北亚太分会、南美分会、南亚太分会、南太平洋分会、南亚分会、泛欧分会。

　　各级管理机构采用代议制，地方基层教会派代表进入区会，区会代表参予联合会的决策。分会委员会中有联合会的代表，全球总会委员会又有各分会的代表。

　　各级教会的决定由委员会作出，委员会包括行政人员(会长、行政秘书和司库)各部门和机构的代表以及平信徒。事关全球教会事务的重大问题在全球总会年会上讨论。反映在本会手册上的教会政策上的变动，只能在五年一次的全球大会，经世界各地教会代表广泛讨论后作出。

　　地方教会无权指派自己的牧师，也无须支付牧师的薪水。地方教会须将信徒的什一上缴区会，区会常常在与地方教会协商以后，向他们指派传道士并支付薪水。地方教会所收取的其它奉献归自己开支，此外还筹集资金，通过上级组织，支持世界各地的传道工作。

　　各级教会均下设各部开展工作，有儿童事工部、家庭事工部，安息日学及个人布道部、管家部和青年部。教育部指导办学，区会通常在本地开办中小学，高等院校则由联合会或分会管辖。卫生节制部制订和实施促进信徒及非信徒健康的计划和项目。公共事务和宗教自由部则指导信徒和教会机构处理与社会和国家有关的事务。出版部监督出版社和书报销售人员的工作。传道协会促进牧师们的效能和福利。传播部负责宣传教会的各种活动。

　　第二次世界大战以前，世界各地的教会领导大多由西方人担任。二战以后，由于大量当地人士担任领导，北美和欧洲人士在国外教会担任领导工作的人数已显着减少。如1998年，只有二个分会的领导由外地区人士担任。几乎所有的联合会和区会会长都由当地人担任，同时全球总会领导层中也含有来自各洲和各种族的代表。

　　基督复临安息日会在世界各地包含着众多的种族、民族和语言。1998年教会出版物的语言多达272种，如果计算口头使用方言，就达到748种了。1998年，北美的基督复临安息日会用26种语言进行礼拜，足见其多样化。其中增加最快，人数最多的语言群体是讲西班牙语的达99,000人，占北美教会信徒总人数的11%。安德烈大学神学院开设西班牙语的硕士和博士学位课程。来自西班牙语群体的牧师担任区会、联合会和分会的领导职务。北美亚裔复临信徒使用的语言还有汉语、朝鲜语、越南语、菲律宾语。基督复临安息日会亚裔教会人数最多的在多伦多，加利福尼亚州，夏威夷和纽约。

　　1998年12月，在北美分会891，176名信徒中，有212，538属1944年组建的黑人教会，并由美国黑人担任领导。北美分会的七个联合会中均有黑人地方教会，尽管其中并非全是黑人信徒。同时有不少黑人在地方教会和全球总会中担任领导工作，如1979-1900任内北美分会会长就是黑人查尔斯布莱福特。阿拉巴马州亨茨维尔市奥克伍德学院自l896年起就招收黑人青年，培训他们为上帝和同胞服务。

　　基督复临安息日会中只有极少女牧师，由于没有正式按立，她们只能在当地教会任职，无权在区会担任领导工作，但有不少妇女在当地平信徒中起着积极的领导作用。她们还在区会、联合会、分会、总会各部门和委员会中发挥作用。